Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms