Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF639Q9UID6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF639Q9UID6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms