Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACFD1Q9UGQ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACFD1Q9UGQ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms