Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP2Q9UDT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms