Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRBP1Q9P2E9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms