Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms