Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABI3Q9P2A4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms