Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDUFAF4Q9P032 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF4Q9P032 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms