Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP5Q9NZZ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms