Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDE1Q9NZC3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDE1Q9NZC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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