Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTEL1Q9NZ71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1Q9NZ71 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms