Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP6Q9NYH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTP6Q9NYH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms