Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND1Q9NY35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND1Q9NY35 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms