Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms