Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM9Q9NXL9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM9Q9NXL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms