Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF38Q9NXL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF38Q9NXL2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms