Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM260Q9NX78 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM260Q9NX78 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms