Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms