Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL11Q9NVR0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms