Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD4Q9NVD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms