Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF3Q9NUQ8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF3Q9NUQ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms