Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZCCHC3Q9NUD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC3Q9NUD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms