Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GINM1Q9NU53 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GINM1Q9NU53 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms