Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A13Q9NSD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms