Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms