Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms