Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HELLSQ9NRZ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HELLSQ9NRZ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELLSQ9NRZ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms