Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNNM1Q9NRU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms