Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DUOX2Q9NRD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms