Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR8Q9NR97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms