Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM8Q9NQV8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms