Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC177Q9NQR7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms