Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB9BQ9NP90 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms