Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUFT1Q9NNX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms