Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA4Q9HCM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms