Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POPDC2Q9HBU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms