Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF2Q9HAK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms