Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHEJ1Q9H9Q4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms