Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPAS39Q9H9C1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPAS39Q9H9C1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms