Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKRIP1Q9H875 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKRIP1Q9H875 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms