Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SENP3Q9H4L4 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms