Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABDQ9H4I3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms