Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKX2-4Q9H2Z4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-4Q9H2Z4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms