Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDQ9H2X0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms