Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM60Q9H2L4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM60Q9H2L4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms