Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms