Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms