Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFDQ9GZP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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