Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2J2Q9GZM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms