Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms